Applikation? Ich hoffe Du machst gerade nicht den fatalen Fehler javascript mit Java zu verwechseln. Den Applikationen hast Du eher bei Java, was aber unvorteilhaft für Webseiten ist.
Und wie man sowas einbindet, lernt man in der Regel auch beim Programmieren. Du musst nur anfangs etwas anders vorgehen und mit Applikations-Bibliotheken arbeiten.