Das ist tatsächlich ein hochinteressanter Gedanke. Tatsächlich könnte man dann überlegen, ob nicht genau diese Zusammenführung der verschiedenen Realitäten nicht zum Untergang Hyrules geführt hat, da nun das Böse in 3 Formen parallel auftreten müsste. Natürlich müsste es dann auch mehrere Helden und Prinzessinnen geben, aber die treten ja meist erst in Erscheinung, wenn Hyrule bereits in Richtung Apokalypse driftet, was in einem solchen Szenario schlicht zu spät sein könnte.
Meine Theorie, dass der Link in BotW in Stasis versetzt wurde, passt da auch ganz gut rein: Zwei Helden sind bereits gestorben, die Shieka (oder wer auch immer mit Hilfe von Shieka-Technologie) wollten den letzten Helden retten...Oder so ähnlich.
Aber ja, ich halte eine Platzierung am Ende der Timeline letztlich auch für das wahrscheinlichste Szenario. Auf die Zusammenführung bin ich in der Form bisher aber noch gar nicht gekommen.